分子反应动力学国家重点实验室(www.sklmr.dicp.ac.cn)依托于中国科学院大连化学物理研究所。其发展和利用国际先进的化学反应动力学实验技术和高精度动力学理论相结合的方法，深入细致地研究重要化学过程中的动力学机理，在原子、分子的层次和量子态分辨水平上揭示基本化学动力学规律，在分子反应动力学基础科学研究中做出重要创新成果，为重大科学技术进步提供基础知识支撑，保持反应动力学研究的国际领先地位，占据国际化学反应动力学研究的至高点。分子反应动力学国家重点实验室一直是国内化学反应动力学的主要研究基地和承担国家重大基础研究项目的牵头单位，已经成为国际上备受瞩目的重要的分子反应动力学研究中心。

 

分子模拟与设计研究组(Laboratory of Molecular Modeling and Design)主要面向生物能源、生物医药、生命科学、生物技术及催化材料等相关领域，发展新的理论计算方法，结合已有的分子模拟与设计程序，与实验工作者密切合作，针对实验所关心的科学和技术问题开展研究。

 

未来，本课题组还将基于NVIDIA Tesla GPU提供的卓越计算性能，将其应用于超大尺度打结蛋白质的变化分析过程中，全面提升分子动力学模拟的速度和分子构象的采样范围和效率，并与实验相结合，提出打结蛋白质的形成模式。为进一步研究打结蛋白质提供可靠的理论支持。

 

案例简介
 

•本案例中，中国科学院大连化学物理研究所分子反应动力学国家重点实验室-分子模拟与设计研究组利用NVIDIA GPU助力分析打结蛋白质的形成过程，利用Tesla K80 GPU的计算极大地加速了分子动力学模拟速度和提升了分子构象的采样效率，对成功分析打结蛋白质的形成通路起着至关重要的作用。

 

•本案例主要应用到拥有NVIDIA Tesla K80 GPU的超级计算机。