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NGC最新更新:用于A100和Arm系统的新版HPC容器

NGC最新更新:用于A100和Arm系统的新版HPC容器

2020-07-02 20:24

#人工智能 #深度学习


如今,研究者们正在穷尽NVIDIA GPU的强大能力,来寻求COVID-19的治疗手段。研究者们利用分子动力学和量子化学HPC应用,进行数以千计的实验,以预测哪些化合物能有效地与蛋白质结合,阻止病毒感染人类细胞。

NGC最近引入了多个新版本的应用程序,这些应用程序被打包在基于CUDA 11的高性能安全容器当中,支持x86和ARM系统。现在用户可以通过NGC部署以下更新版本的应用:

--- AutoDock 4.2
--- CHROMA 2020
--- GROMACS 2020
--- LAMMPS Jun 15 2020 patch release
--- ParaView 5.8 (Index and Optix)
--- RELION 3.0.8

除了HPC应用程序之外,用户还可以部署Folding@Home 容器,从而可以很容易地贡献出其闲置GPU时间,用于蛋白质折叠分析。此外,还可以通过NGC随时部署Clara Train SDK,该SDK可以用于扫描X射线和CT扫描,以检测患者体内的COVID-19病毒。

NVIDIA Topology-Aware GPU Selection (NVTAGS)

为了确保GPU到GPU的通信对于具有非均匀通信的HPC应用程序尽可能有效,NVTAGS是一个用于使用MPI的HPC应用程序的工具集,它能够智能且自动地将MPI进程分配给GPU,来缩短GPU到GPU的总体通信时间,从而加快这些应用程序的求解速度。

NGC容器环境模块

容器在部署HPC应用程序方面变得非常流行。然而,也有许多HPC站点习惯于使用环境模块。考虑到这一点,NVIDIA开发了一个灵活的、开源参考设计,称为NGC容器环境模块(NGC Container Environment Modules),这是一种轻量级的包装器,能够通过环境模块部署NGC的最新容器。

NGC容器环境模块使用了大家熟知的环境模块命令,以确保将学习曲线和工作流程的改动最小化,同时在运行应用程序时能够充分利用容器的优点,如可移植性、可再现性和安全性。

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