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Folding @ Home 算力达到 1.5 Exaflops,全力对抗 COVID-19

Folding @ Home 算力达到 1.5 Exaflops,全力对抗 COVID-19

2020-04-08 10:07

#人工智能 #深度学习


目前已有多达 70 万家用电脑用户下载软件,共同助力揭秘冠状病毒。

这场“战疫”开始于3月25日(星期三)下午1:55。

在这一刻,Folding @ Home 所管理的研究网络可以说已经成为了全球功能最强大的超级计算机。Folding @ Home 于 3 月 15 日发起,组织者呼吁大家一起参与到抗击新型冠状病毒疫情工作当中,捐赠家用电脑的闲置周期,从而创建了一个算力达到百亿亿次浮点计算能力的众源超级计算机

在短短 10 天之内,支持者们就在数十万台家用计算机上下载了该小组的软件,一起助力破解 COVID-19 的“密码”。

Folding @ Home 是一个全部由研究者自愿组成的项目小组。该小组负责人 Greg Bowman 表示:“这太了不起了”。Bowman 还是圣路易斯(St. Louis)华盛顿大学医学院(Washington University School of Medicine)的副教授。Folding @ Home 网络在全球范围内覆盖了包括华盛顿大学医学院在内的 11 座实验室。

他表示:“我们非常高兴能够同时尝试我们所能想到的一切办法,只有这样才能最大程度地提高改善当前疫情的可能性。”

居家抗“疫”的支持者们还为此举行了一场虚拟动画派对,来回应这一重大消息。视频中的学生们在书桌上跳舞,《壮志凌云》(Top Gun)中的英雄们击掌庆祝,饼干怪兽(Cookie Monster)大快朵颐,一小群来自《星际迷航》(Star Trek)、《星际大战》(Star Wars)等的动漫人物齐声欢呼。甚至连动画版的西蒙·考威尔(Simon Cowell)也竖起了大拇指。

在排行榜上,Folding @ Home 的名次也在上升,从年初只有 3 万台计算机,到现在已有超过 100 万台计算机加入其中。

Bowman 估计,其性能已超过 1.5 exaflops(每秒 1.5 百亿亿次浮点计算)。实现这一强大计算能力的功臣之一便是超过 356000 个 NVIDIA GPU。他表示该小组的博客网站很快就会发布更多新闻。

Folding@Home 在推特上庆祝突破百亿亿级大关

揭开 COVID-19 刺突蛋白的神秘面纱



早在 Folding @ Home 算力突破百亿亿次大关之前,研究者们就已发布过一项令人惊喜的研究成果——研究者人员公布了冠状病毒蛋白感染健康细胞的动画。该动画为人们寻找抗新冠病毒药物或疫苗的分子靶标提供了线索(参见上图)。

这项工作基于该小组先前对埃博拉病毒的实验。该小组的工作之一就是探索蛋白质(病毒等生物的基本成分)如何通过折叠变成三维立体形状来执行各种功能。

冠状病毒蛋白的可视化图像需要借助于巨大的计算能力来模拟近乎原子级的相互作用方可获得,这样的影像图片不是依靠智能手机的自拍镜头就能获取的。

达成百亿亿次浮点计算能力

如今,为了解决各类大型科学问题,计算机科学家用来配备服务器的计算机室足有几个网球场那么大。橡树岭国家实验室(Aak Ridge National Laboratory)拥有目前全球最大的超级计算机。其 Summit 系统内置 27648 个 NVIDIA Tensor Core GPU,在 HPL 基准测试中达到 148.6 petaflops(每秒 148.6 千万亿次浮点计算)能力。排名第二的劳伦斯·利弗莫尔国家实验室(Lawrence Livermore National Laboratory)的 Sierra 系统,使用 NVIDIA GPU 可以实现 94.6 petaflops 的计算能力。

这两套系统都由美国能源部运行,美国能源部希望在 2021 年的某个时候启动其首个百亿亿次浮点计算系统。可以说,百亿亿次时代已经开始。此前,Summit 已达成了多个里程碑,比如运行混合精度 AI 任务时达到的 3.3 exaflops(每秒 3.3 百亿亿次浮点计算)。

即便如此,Folding @ Home 还是赢得了大家的赞誉,因为它是首个实现百亿亿次浮点运算的众源项目。

这是一个令人兴奋的成就。想象一下,这相当于每个人手持十亿个计算器,一共有十亿人,这些计算器同时运算,才能达到每秒百亿亿次浮点计算。

您可以通过多种途径提供帮助

为了应对广大用户的热情捐赠,Bowman 在推特上告诉支持者们,研究者急需更多的服务器来保障所有联网计算机的运行。

一位支持者表示:“这给了我机会贡献自己的一份力,而且这个项目对我的精神状态也产生了积极的影响。我希望我说出了大多数人的想法。”

该小组仍在鼓励用户通过软件捐赠他们的计算机闲置时间。而 Folding @ Home 会在开放的普通研究网站和专门的生物学等领域实验网站上公布其实验数据。

为了加快工作速度,Folding @ Home 最近发布了新一批小分子筛选模拟,这将帮助确定 COVID Moonshot 将优先合成和分析的哪些分子。

Folding @ Home 是对抗冠状病毒的众多科技项目之一。

在众多科技公司和大学的支持下,美国能源部建立了 COVID-19 高性能计算联盟。Folding @ Home 将集合 16 台超级计算机的力量,在 36000 多个 NVIDIA GPU 的帮助下一起实现 330 petaflops。

另外,开发者已经在 #BuildforCOVID19 编程马拉松中对各个项目进行了编码。重点项目将于 4 月 10 日宣布。

为了加快对冠状病毒基因序列的分析,NVIDIA 为研究者免费提供 90 天 Parabricks 软件许可证。

Greg Bowman 表示,正如我们所承诺的,这里是我们对 #COVID19 刺突蛋白(又名 demogorgon)作用的第一份研究结果。未来我们将提供更多研究结果!

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