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NVIDIA GPU如何帮助革新癌症研究?

NVIDIA GPU如何帮助革新癌症研究?

2019-06-25 09:00

#深度学习


为了检测细胞的变化,技术人员经常截取部分组织样本,在显微镜下进行检查。但这种方法限制了研究人员对组织完整样本的观察。

 

 “如果怀疑患有乳腺癌,医生会进行活组织检查。 但他们需要将组织切成薄片以将其放置在显微镜下,因此活组织切片仅显示组织的一小部分,“宾夕法尼亚大学计算表型组学计划主任、病理学教授Keith C. Cheng博士说。 “它没有显示任何体积数据,你只能获得细胞的统计抽样。”

 

正因为如此,Cheng博士开始致力于X射线微断层扫描技术(micro- tomography,简称micro-CT)。这种技术通过对组织样本进行一次扫描,就可以获得高分辨率的完整三维图像。对于这种计算密集型的工作,宾夕法尼亚州立大学的研究小组使用NVIDIA RTX GPU对3D模型进行数字重建,并在VR中查看它们。

 

RTX光线追踪帮助研究人员深入研究细节

 

Micro-CT是X射线成像,使研究人员能够从样品中重建3D结构而无需解剖或破坏它们。 NVIDIA RTX GPU有助于快速完成图像重建 - 每个样本大约一分钟 - 允许用户快速访问整个活检的虚拟3D模型。

 

Cheng博士和他的同事在实验室中进行成像,他们在那里建造了一台定制机器。 基于Turing的RTX GPU利用RT Cores加速光线追踪并提供显示大量数据的高质量图像。

 

扫描样本后,团队在桌面上使用VR软件工具syGlass查看图像。 GPU在移动控件时计算可视化,使他们能够在VR中探索,操作和检查3D模型。

 

根据Cheng博士的说法,这种新的3D成像方法产生的细节水平将推动癌症诊断等医疗领域,因为它允许研究人员计算和检测组织中癌细胞的数量。

 

为了展示这种新的RTX驱动技术,Cheng博士创建了一个斑马鱼的数字模型,可以在任何平面上进行虚拟切片和可视化。

 

 “NVIDIA RTX GPU有助于以比我们想象的更快的速度创建3D图像,因此现在我们可以访问更全面的数据,并查看比以往更高分辨率的完整样本。” Cheng博士说。

 

使用最新的RTX技术,专业人员可以创建样本的高分辨率图像,使他们能够分析每个细胞并深入了解可以进一步推进医学研究的数据。

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