是否可以将传统的动力学模型完全移植到GPU上进行加速运算,能够加速几倍?
NVIDIA高级系统架构师易成:
我们现在已经把大量传统的HPC计算软件移植到GPU上计算,比如一些分子动力学软件,物理化学软件,如Amber,NAMD,Gromacs,VASP等,还有一些CFD软件,结构力学计算软件,如ANSYS,fluent,现在都可以在GPU上加速计算。加速效果各个软件各有不同,比如amber,relion,GPU加速可以达到20倍以上;有些软件加速效果会差一些,比如CFD软件,一般只能达到3-7倍,具体算例的加速效果和算例的规模也有关系。所有能在CPU上运行的程序,都能移植到GPU上计算,考虑到GPU计算时间和IO时间各自所占的比率,如果IO时间占的比率较大,我们会让他留在CPU上计算;如果GPU计算时间比率比较大,移植到GPU上就会有较大的加速效果
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